Kazuhiko Miyadera, výkonný viceprezident Toyota Europe pro výzkum a vývoj uvedl: “Dosažení vysoké úrovně pasivní bezpečnosti u automobilu, který je dlouhý pouze 3,4 metru, pro nás představovalo velkou technickou výzvu. Čtyři hvězdičky v testu Euro NCAP jsou skvělým výsledkem.”

Aktivní i pasivní bezpečnost byly při navrhování a konstruování Toyoty AYGO stěžejním faktorem. Mezi klíčové bezpečnostní prvky patří:

• Systém minimálního narušení kabiny Toyota (MICS) - odolná bezpečnostní struktura, která při čelním nebo bočním nárazu efektivně rozptyluje energii po celé karosérii

• Dva přední airbagy pro řidiče i spolujezdce ve standardní výbavě, navíc boční ve výbavě Aygo +

• Varovný systém zapnutí bezpečnostních pásů se zvukovou signalizací

• systém ISOFIX pro upevnění dětských autosedaček na vnějších zadních sedadlech

Vzhledem ke svému designovému určení jako vysoce kvalitní automobil do města věnuje AYGO patřičnou pozornost bezpečnosti chodců. Klíčovou roli v případě srážky hrají oblasti předních nárazníků, krytu motoru a předního spojleru, které obsahují struktury absorbující energii a minimalizují tak poranění chodce.

Aktivní a pasivní bezpečnost jsou považovány za jedny z předností všech vozů Toyota - poslední modely Avensis, Corolla Verso a Prius obdržely v testech Euro NCAP pětihvězdičkové hodnocení za bezpečnost pasažérů.