Nejlepší hodnocení bezpečnosti dospělých Euro NCAP, které Toyota získala.
Vybaveno prvním kolenním airbagem řidiče v této třídě automobilů.
Minimal Intrusion Cabin System - systém minimálních průniků - znamená efektivní rozmístění energie nárazu.     

Nová Toyota Yaris získala 5 hvězdiček v hodnocení bezpečnosti a 35 bodů za bezpečnost dospělých cestujících v nejnovějším kole bezpečnostních testů Euro NCAP.

Těchto 35 bodů za bezpečnost dospělých cestujících je též nejvyšším hodnocením, které kdy Toyota získala. Navíc získal Yaris 2 hvězdičky v bezpečnosti chodců a 3 hvězdičky v bezpečnosti dětí.

Postavit tak bezpečný kompaktní vůz jako je Toyota Yaris je obtížný technický problém kvůli kompaktnosti jejich karoserie a velice krátké přední části vozu. 5 hvězdičkové hodnocení je uznáním Toyoty za poskytnutí tak vysokých standardů bezpečnosti.

Přední a boční airbagy řidiče a cestujících, hlavové airbagy a kolenní airbag řidiče (první v této třídě) jsou též k dispozici - a také varovný systém bezpečnostních pásů (s variabilní hlasitostí) pro cestující na předních sedadlech.

Nová struktura karoserie Toyoty Yaris byla vyvinuta za pomoci Toyota technologie MICS - technologie minimálních průniků - která efektivně rozprostírá energii čelního či bočního nárazu po celé karoserii tak, aby byla odvrácena od prostoru pro cestující a aby se minimalizovala deformace karoserie.

Navíc je nový Yaris prvním vozem, který Toyota vyvinula podle nových přísnějších standardů srážky jednoho vozu s jiným. Simulují náraz v rychlosti 55 km/h (oba vozy jedou rychlostí 55 km/h) s 2 tunovým vozem v čelní kolizi s 50% překrytím a v bočních a zadních kolizích s 50% překrytím.

5 hvězdičkovému hodnocení bezpečnosti dospělých, které nová Toyota Yaris získala, předcházelo 5 hvězdičkové hodnocení vozů Toyota Avensis, Corolla Verso a Prius.